ในช่วงฤดูฝน หรือช่วงพายุเข้า หลายๆท่านที่ติดตั้งแผงโซล่าเซลล์อาจประสบปัญหาในการใช้งาน แต่สิ่งที่น่ากังวลคือ การเกิดฟ้าผ่า ดังนั้นเมื่อติดตั้งแผงโซล่าเซลล์แล้วควรติดตั้งระบบป้องกันฟ้าผ่าไปด้วย เนื่องจากสนามแม่เหล็กบริเวณระบบโซล่าเซลล์จะมีความเข้มข้นสูงมาก จนทำให้เกิดแรงดันไฟฟ้าสูงชั่วขณะในสายไฟของระบบ อาจทำให้เกิดความสเสียหายต่อตัวแผงโซล่าเซลล์เอง รวมถึงเครื่องใช้ไฟฟ้าภายในบ้านได้ ซึ่งเราจะมีวิธีป้องกันฟ้าผ่าระบบโซล่าเซลล์ ดังนี้

ในกรณีที่ไม่ได้ต่อสายดินหรือติดตั้งระบบกันฟ้าผ่าไว้ ให้ทำการถอดปลั๊กจาก Invertor และทำการงดใช้ไฟชั่วคราวในขณะฝนตก หรือมีพายุ
การต่อสายดินให้กับแผงโซล่าเซลล์ ควรติดตั้งในบริเวณพื้นที่โล่งกลางแจ้งบริเวณที่โล่ง เนื่องจากการติดสายดินให้กับแผงโซล่าเซลล์ จะช่วยเป็นตัวนำไฟฟ้าจากข้างบน ลงสู่ดิน
ติดตั้ง Surge Protection Devices (SPD) คือ อุปกรณ์ที่ช่วยในการป้องกันไฟกระชากแรงดันสูงชั่วขณะ ซึ่งจะสามารถป้องกันแผงโซล่าเซลล์เวลาที่เกิดฟ้าผ่าได้